进化树的构建方法?工具/原料电脑MEGA软件方法/步骤1、在NCBI上搜索所需的目的序列。2、以Metallothionein(MT)为例,将所需目的序列复制到Word上,形成如图格式。3、下一步用MEGA7构建进化树
进化树的构建方法?
工具/原料
- 电脑
- MEGA软件
方法/步骤
1、在NCBI上搜索所需的目的序列。2、以Metal澳门银河lothionein(MT)为例,将所需目的序列复制到Word上,形成如(pinyin:rú)图格式。
3、下一步用MEGA7构建皇冠体育进化树。首先打开MEGA,然后点击Align,点击Edit/Build Alignment,然后在弹出的小框中选择Create a new alignment,点击OK,根(读:gēn)据你的需求选择Protein或DNA,如果比对的是核酸则点击DNA,若是蛋白质则点Protein.在此以Protein为例。
4、点击Protein,出现如下第一张图所示,然后将目的序列粘贴。
5、点击Date菜单中的Phylogentic A澳门威尼斯人nalysis点击Yes,然后在主菜单中点击Analysis,点(diǎn)击Phylogeny并选择第二个。点击YES,然后在弹出的框中点击compute。
6、下图即为澳门金沙《繁体:爲》所构建的进化树。
细菌16S rDNA序列分析以后,怎么构建进化树?
有很多方法,可以下载软件也可以在线构建。在线构建可将你的序列输入PUBMED的Blastn中进行对比,结果中有一种就是系统发育树,但里面残余对比的序列太多,逆序挑选一下。软件有很多,比较简单的是DNAstar中的Megalin,但结果比较粗。推荐用ClustalX软件进行同源性比对后,运用MEGA3.0软件进行系统发育分析并绘制系统发育树,也很简单,看看说明就会比较公认的严谨的《de》是phi澳门银河lip系列软件,但操作复杂。
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