研究生毕业论文数据图表处理技巧?不少研究生们可能都有这样的体会:千辛万苦得来的实验结果,不知道该如何展现给别人?的确如此,有些研究工作做得非常出色,可能由于呈现方式的问题,不能发表高水平的文章(尤其是SCI文章)
研究生毕业论文数据图表处理技巧?
不少研究生们可能都有这样的体会:千辛万苦得来的实验结果,不知道该如何展现给别人?的确如此,有些研究工作做得非常出色,可能由于呈现方式的问题,不能发表高水平的文章(尤其是SCI文章)。仔细分析[pinyin:xī]C-N-S系列的大牛文章,不难发现,这些高水平论文的de 图表{练:biǎo}质量也高人一筹。因此,合理的“包装”自己的实验结果非常重要。
一,共聚焦(jiāo)图片
1. 拍照时要保留liú 大中小三个倍数的图,且图(繁体:圖)片分辨率不能太低(我们用1024#2A1024),能大则大,我们是因为机器限制。用的时候要进行裁减,比如文章上放的是200倍和400倍的图,实际上200倍的图来自拍照时100倍的图,400倍的图来自拍照时200倍的图。这样有利于准确地形成系列图片。
2. 图片对比度、中间色之类可以(或者是必幸运飞艇须)在保证趋势的基础上(读:shàng)进行适当调整。
3. 荧光图片不提倡定量【读:liàng】,定量要配合western。
4. 应该是tif格式(pinyin:shì)。
5. 拍照时一般不要把对比度调节的太大,尽量保存细节。拍(pinyin:pāi)的太强了后期(拼音:qī)是不好调{练:diào}弱的,或者背底太暗了也会丢失细节的。这些后期都可以通过软件调节。
6. 低倍-高倍的顺序。反之会形成暗区,特别是在高倍加zoom放大层扫之后特别明显。这是教训,不能看见高倍下面比较好《练:hǎo》的结果,就欣(pinyin:xīn)喜若狂,先高倍后低倍。
7. 一定要保留你的oib格式,不能因为省空间,只存留tif格式。有些杂志会要求伪色,比如,红色的用粉色显示,要是有oib格式就很好调整,重新出图就是。没有oib,用tif也可以用其他软件转换,但总(繁体:總)觉得最后的(pinyin:de)颜色不是很对,因为很难把握粉色的色值。
8. 层扫的图片叠加或出【练:chū】2D的tif图,建议不要用“输出所见”这个选项,这样出来的1024-1024的会变成512-512,这时《繁:時》候还是选择一般tif,1024-1024,后期再用其他软件合成会比较《繁体:較》好。
9. 结果好,拍照好,才是最基本的,一定要杜绝对结果的修改。对于形态学的图片来说,用软件修改后的用一些二进制的软件打开后【练:hòu】可《kě》以明显看出修改过程。这是同学告诉我的,自己没试过,因为没这样修过。
二,幻【pinyin:huàn】灯片
实验室就非常强调你的汇报能力。幻灯片至少是要无懈可{pinyin:kě}击。可能你的工【练:gōng】作很漂亮,但是你做了一个很粗糙的幻灯,而且讲的也很粗糙,这样,别人对(duì)你的评价就会打折扣
我一般喜欢用prism作图,非常漂亮,而从来不用excel作图【练:tú】。而幻灯,思路要很明确,背景要介绍清楚(pinyin:chǔ)。然后大家一定要控制时间,给你十五分钟,最好是留有10s的空余,但《dàn》是一定不能多,也不能讲到十分钟就结束了
三、图[繁:圖]片
目前杂志投稿没有一个统(繁:統)一的标准比较麻《读:má》烦,比如照片的DPI不同杂志要求就不一样,有的杂志甚至单独要求Merge图片的DPI,还有的连统计图的线粗细磅数也要求不一样。这就造成一稿被拒,还要重新治理很多照片和统计图,非常麻烦。
1. 首先对文章中图片的逻辑关系要十《练:shí》分清楚,针对results部分排好序,而且开始的时候要多准备一点图片piàn ,挑出几张拍摄效果好的,在投稿的时候,除了你认为最好的那张图以外,还可以放几张备选图到附件中。
2. 图片的排列一定要有逻辑性,不管是从大体形态到分子机制,还是[读:shì]从分《读:fēn》子机制再{zài}到形态学,不管按照什么方式叙述,都要按照一定的逻辑顺序。
3. 图片要尽量的精美,而且要每组图片要保留几个备《繁体:備》用的图片,以免(miǎn)要求修改时,找不到合适(繁:適)的图片。
4. 要注重细节,放在PPT上排列时,要注意上下(xià)左右的图(繁体:圖)片尽量对齐,包括用来放在柱形图《繁:圖》上的小星号,一定要对齐,放好。
5. 代表趋势变化的图,一定要能看出趋势。不明显的图就《拼音:jiù》不要放在上面了。
6. 如果是大体照片,比如关节炎肿胀的照片,要放一个(繁体:個)尺在背景中,这样即使照片焦距不一样,有了尺的刻度《读:dù》在照片里,就很能说明问题(尺的刻度随照片大小改变而改变)。
7. 在excell中作的柱状图或线图,我一般都[练:dōu]是用字体14号,字形加粗,线条《繁:條》粗细在1.75到[pinyin:dào]2.0。
8. 当然《拼音:rán》大家想要得到精美图片掌握photoshop等作图软件是少不掉。
9. 几幅《读:fú》图如何排版,最好看看级别高的杂志,他们是如何排版的。
10. 每次都感叹老外的综述性文章的图片(练:piàn),看的很直观,这次我也发表了一篇综【繁:綜】述性文章,找一个做动漫的高手,将我个人的想法在photoshop上画了一个精美的图片,故有时可以请专业人士帮忙。
11. 对于病(拼音:bìng)理的图片,照相时要加标尺,一般用Tif保存,尽可能保存分辨率高的图片(以后再压缩都行)。我一般都是100倍的照(拼音:zhào)1张,200倍的照4张,400倍的照4张。
12. 图片要在PPT或paper中呈现的时候,最好加一个边(繁体:邊)框,图片piàn 之间不要距{读:jù}离太宽,这样要好看些。
13. 组合图片时,一般用ph澳门威尼斯人otoshop.注意细节,上下左右要对【duì】齐。每个图片的背景要调整一致。
14. 做统计图时,用origin,Prism,sigmaPlot。这样做出来的图确[繁:確]实要好看,而且容易调整间距,字体等。当[繁体:當]然用EXCEL也能做出好看的图,但是需要仔细修改,比如要去除网格线。
15. 所有的图片最好hǎo 符合黄金分割原理,长宽比例控制在1.6左右。图中重点强调的内容一定要加粗,或者用很醒目的符号。总之最能吸引人眼球的地方《练:fāng》就是你文章最重要的部分。
16. 图片的英文字体最好用Arial。
四【练:sì】、图表
1. 完整性。图表应包含摘要yào 中所有的重要结果,并且信息量要比摘要更丰富,这样才显得丰满。但也要注意别把所有结《繁:結》果都堆砌上去{读:qù},这样反而会干扰文章的逻辑主线。
2. 逻辑性。实(繁:實)验结果不同部分的图表必须互相联系,形成一个连贯的逻辑链【练:liàn】条,以支撑文章的结论。如果只看图表不看正文也能自然地得出结论的话(繁:話),那说明其逻辑主线是非常清晰的。
3. 精炼的文字说明。配以文字说明,使得【读:dé】图表易读易懂,但一定要简洁精炼,否则还不如去看结(繁:結)果的文字部分呢(读:ne)。
4. 把握一些细节问题。比如图与图之间的间距以及字体的大小、位置应保持一致,图片中指示箭头与背景的对比要明显...等等。图表及文字说《繁体:說》明的【pinyin:de】排布要力求整齐划一,给审稿人一个严【练:yán】谨的印象。
五(拼音:wǔ)、论文
1. 条理清(pinyin:qīng)晰:编号要有条理,可以所有的都不《拼音:bù》编号,也可以编成1,1.1,。。等等,但(读:dàn)一定要前后一致。
2. 丰富多样:我认为一篇论文中应该有图有表,有的数据既(pinyin:jì)可以以表(繁体:錶)格形式表示,也可以用Excel画(繁体:畫)出图,那么就应该看看文章中缺什么,比如图比较多,那就画个表,等等。
3. 对于文章的格式,有一些具体的要求:字体 (Font#29:Time世界杯s New Roman,字体大小 #28Font size#29:12 (即小四),行距 #28Spacing#29:双(繁体:雙)行 #28double space#29,纸张:8.5-by-11-inch (相当于A4),纸张边距 #28Page margins#29:各留 1 inch。
4. 书写要求:右边不对齐 #28do not justify the lines at the right margin#29,每{拼音:měi}段第一《pinyin:yī》个单词嵌入1 inch #28Tab键,或《读:huò》五个空格)。
5. 对于图,首先要写好Figure legends,“readers do NOT need to look at the text to find out what the figure means ”,所以yǐ Figure legends要《pinyin:yào》叙述清楚。
6. 绘图工具【练:jù】:Photoshop or powerpoint
7. 图片大[dà]小:one-column or two-column
8. 字体选(繁:選)择:Helvetica or Arial
9. 如果数据比较多的时候尽量放到表里面[繁:麪],减少结果部分文字的篇幅,我有一篇文章审稿人就要求《读:qiú》我把文字zì 部分的数据放到表中。
10. 图中尽量多做标注,最好做到dào 不看legend也能看懂图的内容。
11. 图的数量不宜太多,不重要的(练:de)图不必显示。
12. 示意图宜简单明了,无关《繁体:關》的东西不需要
六、如何做免【练:miǎn】疫组化的图
免疫组化做完后就要进行目的蛋白表达水平的评估,就是读片的过程,期间可以留意哪些染色具有代表性,可以作为文章中的图,用显微镜拍好后,接下(拼音:xià)来就是如何将这些代表性的图(如weak,moderate, stong staining)合成一(练:yī)张图。
1.将不同的图同时用【yòng】Photoshop打开,同时新建一张背景图。
.考虑到美观,可以采用圆形选择工具,比如直径为2cm,在每张图(繁:圖)上进行选择,将选好【读:hǎo】的区域拉到新建的背【繁体:揹】景图上。
3.注意各(读:gè)个图之间要对齐,可以采用参考线进行【读:xíng】对齐或将不同图层进行链《繁:鏈》接,然后再对齐。
4.根据不同杂志的具体要求,设置图的大小及分辨率《练:lǜ》(DPI)。
七(读:qī)、作图软件
老板曾经给我说过,一定要十分注意自己放到文章里的图片,好的图(繁体:圖)片更容易让编辑对你的文章产生好感;而且,不完善的图片一旦发(繁:發)表,它是永{练:yǒng}远不能被撤下来的。过一段时间,你自己看着就很难受。
我以前习惯于用excel作(pinyin:zuò)图,老板已经不允许了{练:le},现在全部换成graphpad prism 5 和canvas 11了,刚开始的时候,用着这两个英文软件也不是很顺手,用久了,果然发现这两个软件作出的图片和图表的确质量要好很多,而且,再次改起来也很方便。graphpad prism 5还可以直接做统计分析。至于图片的初级处理工作,一般都是在image j和photoshop里做的。image j是个功能很强大的软件,可以在网上免费下载自己需要的插件,完成自己特定的要求。
互相交流(pinyin:liú),共同进步。
确实如此,作图软件也是《读:shì》影响图片质量和作图效率的一个关键因素。作图软件(或者统计软件)往往因各人的习惯和实验数据的特{拼音:tè}点(拼音:diǎn)而异。
就我个人而言,我的实验数据大(读:dà)都是{读:shì}电生理和形态学方面的东西,我(wǒ)觉得比较合适的软件是:
1.电(繁体:電)生理:Igor 4.0 miniAnalysis Plusfit
2.形态学:photoshop;IPP
3.统计软件:spss,excel(一《读:yī》些简单的数据分析还是很实用的)
的确如此,写文{pinyin:wén}章过程中需要的主要软件工具。关于实验方面的,不同专业要求不一样《繁体:樣》。在这儿我想说的是,从原始数据到文章成稿的过程中,你可能用到的软件工具:文字的(e.g. Word )、图形的#28e.g. Origin, sigmaPlot,photoshop#29、数据分析统计的#28e.g. Excel, SPSS or SAS…#29、数据模拟 的#28e.g. MathCad, Matlab…#29、文献管理的#28e.g. Endnote…)及其专业软件。
在这过程中,图片的处理尤为重要!您想让自己的图片(练:piàn)在文章中看起来更清晰,为您的文章增添更多吸引人的地方除掉软件以外你的de Tables, Figure captions, and Figures, 还应具有科学性、新颖性和逻(拼音:luó)辑性,有时候可观赏性很重要。
在英文综述性文章中,用示意图能很好将复杂问题简单化!需要一定的de 作图功底能力(读:lì)。
个人觉得大家在作图时,不要太迷信用专业(繁体:業)的作图软件,现有的常规软件word、ppt,只要你用心转研,一(练:yī)样可以做出精美的示意图。我之前在一次会议的时候看到一个高手做的示意图,很是漂亮,下来一问,居然是用ppt做的,回来一《读:yī》试,果不其然,自己也能做出很漂亮的彩图,这次直接在国基中派上用场。希望(wàng)大家能够好好发掘现有的软件和素材,小块头也有大智慧,呵呵!
八、采集原始结[繁:結]果的原则和方法
稿件中的图(读:tú)片大体可以分为三类:1)来自数码相机,如显微镜下或大体照片等;2)来自采样软件,如powerlab的动[拼音:dòng]作电位图、血压图等;3)来自统计作图软件,如Excel的柱状图等。
操作的三大原则:1)原始图像要保留,修改后的图像务必另存而不要覆盖原始图像;2)尽量减少保存次数,以免损失图《繁:圖》像质量,可以多处修改,一一完毕后再做存盘;3)所有操作不得使图像失真,任何影响图像真实性《拼音:xìng》的修改都是不允(练:yǔn)许的。
任何修改工作都是在原始图像的基础上进行,所以如果原始图像质量不佳,那必将事倍功半。下面对[繁体:對]有利于(繁体:於)原始图像质量的细节略做介绍。不同来源的图《繁:圖》像,其注意点也不一样,因此分开讨论。
1)来自照相的 获得的数码文件多是在《读:zài》显微镜视野下采集的,因此聚焦和暴光是必须要考虑的。显微镜下景深极浅,意味着聚焦清晰(练:xī)不能依赖于小光圈,而应靠精细调节显微镜。注意应使照相通道和目镜观察通道相一致,即目镜下最清晰时拍照也最清晰
拍照时相机应选择最大光圈,广角《读:jiǎo》端。不要使用望远变焦,它使得视[繁:視]野变小且放大倍数难以计算。聚焦不清的另一主要问题在于相机的抖动
虽然一般相机都固定在显微镜上,但按快门时的手震有时仍不可忽视,这时一个简单的办法是利用相机的自拍功能,按下快门之后经倒数计时后正式拍摄。暴光时间的选择在一般的明视野下可由相机的自动暴光决定;而暗视野下有时需要高达几分钟的暴光时间,这是一般数码相机达不到的,只能通过专业的【pinyin:de】CCD系统并用【练:yòng】软件帮助采集图像。一些软件可以用来修改暴光不足的照片,但暴光过度往往使图像细节丢失
显微镜下拍【练:pāi】摄时闪光灯不起作用,将它关闭。通过白平衡,一般不会产生严重的偏色。另外,由于镜头的原因,边角处难免会有失真,因此,请保证目标在视野正中,镜头成像最佳范围内,而无须铺(拼音:pù)满整个视野,现在的数码相机的像素值已经足够高了
2)来自采样软件的(读:de) 采样软件所采得的原始图形一般储存在特定格式的文件中,通过该软件或配套的分析软件打开。有的采样或分析软件可以将图形直接输出到Word或Photoshop中,但有的则不能。这时最简单的办法就是通(拼音:tōng)过抓屏或抓图软件来获取
通过采样软件获取的图形输出后仅做些切割、拼合的工作,不应{练:yīng}该做更多其它的修改。图形在采样软件中可以通过改变x轴和y轴的缩放比改【读:gǎi】变形状,因此一组图片应该选择统一的标准,并且标注x, y轴的标尺。图形{pinyin:xíng}的精细程度和采样频率相关,采样频率越高,图片越精细
图片中不必要的颜色信息可以在Photoshop中丢(读:diū)弃。
3)来自统计作图软件的 常【pinyin:chá幸运飞艇ng】用的统计作图软件包括Origin、Sigmaplot、Excel等。这些软件作的图一般都可直接输出到Word及Photoshop中。统计图的标注等应多在统计软件中完成,输出后不宜多做修改
图中尽量(pinyin:liàng)不要用颜色或灰度来区别组间,而多利用形状特征。如Excel的柱状图,选择“填充/图案”,里面有足够多的(pinyin:de)选择项。
九、生存(cún)曲线的作图方法
可以来做生成曲线的de 软件很多,比如SAS,STATA,SPSS等。这里以SPSS为例,介绍生存曲线【繁:線】的做法。
1)分别将{pinyin:jiāng}随访天数(TIME),结局变量(YES or NO),不{读:bù}同分组及处理方式(TREAT)输入软件。激活Statistics菜单选Survival中的Kaplan-Meier...项,弹出Kaplan-Meier对话框。将各个数值输入对应的对话框中,再点击OK钮即完成分析。
2)对软件生成的生存曲线,可以进行手动编辑,双击需xū 要调《繁体:調》整的曲线,可以选择合适的风(繁:風)格(style)及颜色(color)。
3)将图像用photoshop打开,选择文字工具,给图【练:tú】像加上标(biāo)题、副标题及坐标值说明。标题及{jí}副标题字体为Arial, 12号,其他字体均为Arial, 8号。
4)采用各种选择工具(如【练:rú】矩形选择工具)来调整【zhěng】图像中不同标题及坐标(繁:標)的相对位置。
5)根据需xū 要选择合适的分开云体育辨率,一般为300#28DPI#29。这是我做的一张生存曲线图。
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